一、实时荧光定量PCR(Real Time PCR)技术原理:
实时荧光定量PCR(qPCR),利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。PCR反应过程中产生的DNA拷贝数是呈指数方式增加的,随着反应循环数的增加,最终PCR反应不再以指数方式生成模板,从而进入平台期。将已知浓度的标准品梯度稀释进行Real Time PCR,按照起始DNA量由多到少的顺序等间隔得到一系列扩增曲线。Ct值与起始模板数的对数值之间存在线性关系,可以制作标准曲线。未知浓度的样品也得到Ct值,代入标准曲线,就可以求出未知样品的起始模板量。
Real Time PCR的定量原理图
二、实时荧光定量PCR(Real Time PCR)应用进展:
Real Time PCR是具有划时代意义的技术,具有操作简单、快速方便、灵敏度高、重复性好、污染率低等优点,不仅应用于基因表达解析,还广泛应用于SNP分型解析、物种鉴定、病毒和病原菌的检测、转基因食品的定量分析、导入基因拷贝数的解析等诸多领域。
阈值(threshold): 在扩增曲线的指数增长区域内适当位置上设定的荧光检出界限。
Ct值(Cycle threshold): 表示每个PCR反应管内荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。
经数学理论证明,Ct值与起始模板数的对数值成反比线性关系。

阈值和Ct值的相互关系图
三、实时荧光定量PCR(Real Time PCR)部分专业名词:
决定系数(r Squared)
反映标准曲线的直线性,理想值应大于0.98,越接近于1说明直线性越好,定量越准确。
斜率(slope)
反映PCR扩增效率,-0.25~-0.33(根据不同装置数值不同)。
扩增效率(E)
理想扩增效率应在0.8﹤E﹤1.2。

标准曲线的评价指标图例