1. 绝对定量：是对未知样品的绝对量（拷贝数）进行测定的方法；通常应用于病毒、细菌、衣原体、支原体的定量检测及转基因食品的检测。
绝对定量标准曲线的制作方法：扩增目的基因片段或全长（比real time PCR的基因片段要大），构建入质粒载体，扩增抽提鉴定，测定浓度，根据公式换算成copy/μl或copy/μg，然后制作标准曲线，如从100copy/μl的浓度开始，以10倍的梯度做一系列的点，以各浓度以及对应的Ct值制作标曲，计算曲线的R2，以达到0.999以上为佳。取一定量的样品模板（对照组和实验组）进行real time PCR，根据得到的Ct值，计算目的基因的浓度。
2. 相对定量：是分别测定目的基因和参比基因的量，再求出对于参比基因的目的基因的相对量，最后再进行样品间相对量的比较。主要用于检测细胞mRNA表达量的变化；比较不同组织的mRNA表达差异；验证基因芯片、siRNA干扰的实验结果。
因为考察目的是扩增效果，不是考察里面的核酸的量有多少，所以相对定量不需要预先知道样本内的核酸含量。
