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产品选择指南

qPCR引物的设计


进行 Real Time PCR 反应时,设计反应性能良好的 PCR 引物非常重要。根据以下原则,可以设计PCR 扩增效率高,反应特异性强的良好引物。

1PCR扩增产物长度:80 ~ 150 bp较为合适(可以延长至300 bp);

2、引物的最适长度为17 ~ 25 bp

3、引物的GC含量为40% ~ 60%,最好为45% ~ 55%

4、上游引物和下游引物的Tm值不能相差太大;

5、引物ATCG整体分布尽量均匀,不要有部分的GC富集或者 AT富集,尤其是在3’端;避开T/CA/G的连续结构;

6、引物3’端碱基最好为G或者C,尽量避免3’末端碱基为T

7、避开引物内部或者两条引物之间有3个碱基以上的互补序列。两条引物间的3’末端避开有2个碱基以上的互补序列;

8、使用Blast 检索确认引物的特异性。